《少年骇客：变身之谜》是由Sebastian Montes和Scooter Tidwell执导，Tara Strong、Meagan Smith配音的动画电影，是《少年骇客》系列的剧场版。该片于2007年8月10日在美国上映，讲述了田小班在与董悟博士战斗时，Omnitrix被不明光线激活自毁模式，他与钻金刚一起前往外层空间寻找Omnitrix的发明者阿兹米斯，以阻止自毁模式并保护宇宙安全的故事。
剧情简介
田小班在面对董悟博士时，被一道不明光线波及，启动了Omnitrix的自毁模式。钻金刚（和钻石战神是同一个星系的人）接收到信号后赶到地球，告知小班他们必须深入外太空找到Omnitrix的发明者阿兹米斯，才能阻止自毁模式，确保小班和整个宇宙的安危。
小班在和董悟博士交手的时候摧毁DNA炸弹，可是爆炸也影响Omnitrix造成Omnitrix出现不正常的能量爆发。钻金钢找到小班、小玟和马克，告诉他们Omnitrix已经进入自毁模式，要找到发明者解决这个问题。钻金钢带小班寻找发明者，小玟也溜上航天飞机。
他们根据讯号抵达监狱星球阴克西卡找到玛亚丝，她是Omnitrix真正发明者阿兹米斯的助手。另一方面，魔贾斯也追踪Omnitrix的讯号想要抢夺。小班随剧情知道如果Omnitrix自毁不只是不能变身，爆炸的威力也足以炸掉他自己甚至威胁宇宙。钻金钢以前曾经效命魔贾斯造成自己族人灭绝，他严厉训斥小班英雄的意义。
到达阿兹米斯的实验室，好不容易让原本冷漠的阿兹米斯愿意帮忙。魔贾斯抵达试图抢夺Omnitrix，阿兹米斯将调整过的Omnitrix交给小班让小班首度变身超巨人，最后将魔贾斯丢到太空。阿兹米斯要迁移实验室，玛亚丝重新成为阿兹米斯的助手。
钻金钢将小班和小玟送回地球，小班、小玟和马克继续他们奇特的暑假。
角色介绍
幕后花絮
《少年骇客：变身之谜》建立在《少年骇客》（Ben 10）故事的基础上，于2007年8月10日在美国首播。尽管首播时间早于《少年骇客》的许多集数，该电影已被官方设定为《少年骇客》的结局。在时间线的部分，取代原本《Ben 10 vs. the Negative 10》成为正统故事线的结局。在台湾的电视播出时，该片以独立的电影形式播出，而没有跟随剧集进度。在发行的《Ben 10》DVD中收录了该片，中文标题名为“Omnitrix的奥秘”。此外，这部影片有三个版本，差异在于小班使用不同的ET摧毁董悟博士的脱氧核糖核酸炸弹，分别是火焰人、大眼怪和快闪之星。